Con la intención de instaurar un Sistema de Gestión de Calidad tanto en Farmacias Comunitarias como Hospitalarias, es necesario documentar todos los procesos y productos resultantes de la Formulación Magistral. Para ello, recurrimos a unos documentos escritos en los que quedan reflejados todos los procesos que se llevan a cabo de acuerdo con unas pautas procedimentales estrictas y fielmente reproducibles. Estos documentos son los "Protocolos Normalizados de Trabajo" (PNTs) y podemos definirlos como "documentos ordenados en los que se recogen una serie de normas de actuación, con el propósito final de optimizar la realización de los procesos y el control de sus resultados".